Técnicas de laboratorio
Marzo 25, 2008
En cuanto a las técnicas de laboratorio aprendidas durante la investigación, han sido varias a lo largo de un año y un poco más, ya que cuando comenzé era “prepa” en la materia.
Metro de pH: La técnica más básica fue llevar la solución amortiguadora al pH deseado utilizando metro de pH. Aprendí a calibrarlos bastante bien ya que tomó tiempo acertar por un metro de pH que funcionara adecuadamente porque siempre me tocaban los metros o electrodos dañados. Es muy importante que se sea específico en la medida de pH porque afecta drásticamente los resultados del experimento.
Liofiloización: Esta se utiliza para remover el agua del compuesto o sustancia deseada. El tiempo que tarde dependerá de la cantidad de muestra. El que contiene la muestra se sella con parafina, a esa parafina se le hacen unos pequeños agujeros, el envase se coloca en nitrógeno líquido y luego en el equipo para liofilizar. Yo utilizé el equipo de la Dra. Pastrana, quien puso a liofilizar mis muestras (junto con la técnica de laboratorio) en diversas ocasiones.
“Rotary Evaporation” o evaporación al vacío: Utilicé esta técnica para remover DMF (disolvente) en uno de los pasos de la síntesis de mi compuesto. Es un aparato poco extraño y ruidoso, que tiene que estar bien sellado, asegurarse de que siempre que esté funcionando tenga nitrógeno líquido, y manejarlo con cuidado. Luego de al menos 15 minutos obtendrás tu compuesto, separado del disolvente particular.
Espectroscopía RMN de protón (1D): Esta técnica es esencial para el proyecto ya que nos permite verificar la pureza del compuesto sintetizado y si realmente se sintetizó el compuesto deseado. También nos sirve para observar interacciones y hacer estudios cinéticos. Como la mayoría de ustedes ya conoce, básicamente mide giros mágneticos de los átomos. Estas señales obtenidas en un espectro son integradas poder analizarlas. Para poder hacer esto hay que conocer bien la teoría, tanto cómo analizar un espectro como lo que se espera del espectro (desplazamiento químico y demás). Esta técnica a pesar de que es la más fácil de realizar experimentalemente, es la que más tiempo toma al analizar. La paciencia y amabilidad de Aracelis Cardona (técnica) y el programa MestreC facilitan un poco esta tarea.
COSY (COrrelated SpectroscopY) (2D): Técnica que correlaciona las señales de los espectros obtenidos al mostrarlos en dos dimensiones. Al correlacionar las señales nos permite saber cuales de todas las señales estan relacionadas unas con otras (que señales serían “vecinos” inmediatos en una molécula o complejo). Hasta ahora es la técnica que más complicada se me ha hecho analizar.
Actualización
Marzo 25, 2008
Desde el último post no hemos logrado analizar apropiadamente los resultados de las interacciones estudiadas, por la falta de un programa utilizado para integrar las señales de los espectros (MestreC). Sí logramos hacer la misma interacción entre GSH, GMP, Ala pero con otros dos complejos: cisplatino, para utilizarlo como “control” y otro derivado de cisplatino cisPt-5-metiltiazol.
Visita a Bioblogs
Marzo 25, 2008
Al visitar los blogs de algunos de mis compañeros de BioMINDS observé cuán distintos pueden ser los proyectos de cada auno de nosotros, aunque todos directa o indirectamente relacionados de alguna manera. En los blogs que logré visitar habían interesantes proyectos de ecología, microbiología y bioingeniería. Cuando comenzé a leer el de bioingeniería, me pareció curioso que el estudiante es de ingeniería mecánica y de momento no lo relacionaba con biología. Al leer sobre el proyecto me dí cuenta de la importancia y aplicaciones de estas y otras disciplinas en el área de biología.